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GeneGPT（基因GPT） ：美国国家生物技术信息中心（NCBI）开发的工具。主要通过他们的NCBI Web APIs数据库，来改进大语言模型对生物医学专业知识的处理能力。能够为用户查询提供基于最新科学研究和数据的准确答案。它可以进行人类基因组DNA比对、蛋白编码基因识别、基因疾病关联等多种任务。GeneGPT的功能特点：1、生物医学工具的集成使用： GeneGPT通过教导LLM如何有效利用NCBI Web APIs等生物医学工具，允许LLM在回答查询时，不仅依赖于预先训练的知识库，而且能够实时访问和利用专业数据库中的数据。2、新颖的解码算法： GeneGPT采用了一种特别设计的解码算法，这种算法能够识别需要执行的API调用，并自动执行这些调用以获取信息。这使得GeneGPT能够为用户查询提供基于最新科学研究和数据的准确答案。3、上下文学习与API演示： 与传统的仅依赖文档进行学习不同，GeneGPT通过在上下文中提供API调用的具体示例，使模型能够更直观、更有效地学习如何利用这些工具。这种学习方法提高了模型的理解和执行API调用的能力。4、处理复杂查询的能力： GeneGPT不仅能处理简单的直接查询，还能处理需要多步骤API调用链的复杂查询。这表明GeneGPT具有高度的理解能力和从多个角度检索信息的能力，以回答更复杂的问题。5、针对生物医学领域的优化： GeneGPT专门为生物医学信息的检索和处理设计，考虑了这一领域的特定需求和挑战。这种专门化的设计使得GeneGPT在生物医学研究和实践中具有重要的应用价值。GeneGPT的评估结果显示其在多个任务上的出色性能例如，基因别名识别（0.84），基因疾病关联（0.661），基因位置（0.66），多物种DNA比对（0.88），基因名称转换（1.0），蛋白编码基因（1.0），基因SNP关联（1.0），SNP位置（0.98）。论文：https://arxiv.org/abs/2304.09667GitHub：https://github.com/ncbi/GeneGPT
