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「多伦多大学团队使用AlphaFold获得对蛋白质结构的新见解」
链接:https://news.miracleplus.com/share_link/11645
AlphaFold 蛋白质结构数据库包含数百万种蛋白质的预测结构。对于大多数含有本质无序区域 (IDR) 的人类蛋白质,这些区域不采用稳定的结构,通常认为这些区域具有较低的 AlphaFold2 置信度分数,反映了低置信度的结构预测。多伦多大学(University of Toronto)的研究团队表明 AlphaFold2 为近 15% 的人类 IDR 分配了可信结构。通过与已知条件折叠(即在结合或其他特定条件下)的 IDR 子集的实验 NMR 数据进行比较,研究人员发现 AlphaFold2 通常可以预测条件折叠状态的结构。基于已知条件折叠的 IDR 数据库,该团队估计 AlphaFold2 可以在 10% 的误报率下以高达 88% 的精度识别条件折叠 IDR。同时,研究人员发现人类疾病突变中条件折叠的 IDR 比一般 IDR 丰富了近五倍,并且预计原核生物中高达 80% 的 IDR 会条件折叠,而真核生物 IDR 的比例不到 20%。(齐思)
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